防水透气膜PTFE是高度结晶聚合物，其生料结晶度最高可达到92%〜98%。但是在加工或经过烧结-冷却后，结晶度降低到不超过生料结晶度的70%。PTFE在19℃下时，呈每13个链接旋转180℃的空间螺旋状构象，在19℃以上，同样旋转180℃所需要的链节单元增加到15个，这是因为每个链节的距离上升为0.195nm。这一变化意味着粉状颗粒的硬度在19℃以下和以上有明显的差别。在19℃以上时，键具有某种程度的角向位移，这种位移会随着温度升髙而增加；在30℃以上时，这种能位移的趋向不断增强，直至327℃。这意味着，在19℃以上颗粒较柔软，易变形。这对于PTFE树脂的后处理工艺选定、物料在流水线上的移动方式和设备的设计、包装方式和储存温度的确定都有很重要的指导意义，对于用分散PTFE树脂经糊状挤出后用拉伸方法制造薄膜选用温度也具有关键作用。
温度在19℃以下时，PTFE的晶态是三斜晶系晶格，在19℃时出现晶型的转变，链段的旋转度变得稍小些，单位晶格转变为六方晶系。30℃时， PTFE晶体出现结晶松弛，键有序的旋转变为无规缠绕。通常将这两个温度点称为相转变点。
防水透气膜PTFE树脂的高结晶度和很高的分子量导致PTFE具有极高的熔融黏度，在380℃测定的运动黏度为1010~1011Pa.s，在熔点温度下，也不具有流动性。因此，普通PTFE树脂不能用通常适用于可熔融加工塑料的加工方法加工制品，悬浮PTFE树脂只能用类似粉末冶金的方法进行加工，即将悬浮PTFE树脂粉置于模具经压缩预成型，分散PTFE树脂则需加入助推剂（润滑剂）成糊状方能推压预成型，它们都须经过烧结才能成为制品。
防水透气膜具有极高熔融黏度是它能在很高温度下正常使用的主要原因。
